呼伦贝尔副都统衙门始设于1732年（雍正十年），终止于1932年伪满洲国成立，200年来一直是呼伦贝尔地区集军政职能为一体的最高衙署。

在呼伦贝尔副都统衙门设立之前，呼伦贝尔地区不仅人烟稀少，更无村屯集镇。中俄《尼布楚条约》签订后，位于中俄边境的呼伦贝尔的战略地位愈发显得重要。为了巩固边防，清廷决定设立呼伦贝尔副都统衙门，统辖新组建的“索伦八旗”，以及后两年组建的“新巴尔虎八旗”。随着呼伦贝尔副都统衙门的设立，拉开了草原城市海拉尔的建城序幕。

732年，清廷“移民实边”时，初曾考虑在今海拉尔附近的扎罗木德一带建城。后因扎罗木德一带霜降太早等缘故，改勘伊敏河左岸（今海拉尔城河西区），当时“筑土房为围”，“垣缺处间筑土障高丈许”，城围4余里，称“呼伦贝尔城”。“道光二十七年，建南北二门，起砖楼于其上，街心建中门一座，东西二门初以木栅为之，光绪三年改修土平门并去街中心门，城内南北街二，东西街一，城外街道四，西门外南北街最长，孔道北接站界新街。在呼伦贝尔这个曾一度荒无人烟的偏远地区，初具规模的呼伦贝尔副都统衙门的兴建，却标志着一个草原新城的诞生，其历史作用是不可低估的。